Коронавирус привезли в Россию в конце апреля – начале марта, и не из Китая

Российские ученые пришли к выводу, что разные варианты SARS-CoV-2 были завезены в РФ многократно и в подавляющем числе случаев – из Европы, при этом страна не стала «экспортером» собственных вариантов вируса. Статья, написанная по итогам исследования, проходит рецензирование, она выложена на сайте medrxiv.org 17 июля – об этом сообщил главный исследователь, доктор биологических наук, профессор Сколковского института науки и технологий (Сколтеха) Георгий Базыкин на своей странице в фейсбуке.

Ученые из Сколтеха, НИИ гриппа имени А.А. Смородинцева, Института проблем передачи информации РАН, НМИЦ травматологии и ортопедии имени Р.Р. Вредена и Национального исследовательского университета «Высшая школа экономики» проанализировали 211 полных последовательностей генома коронавируса, выделенных от российских пациентов, в период с 11 марта, когда в стране было подтверждено 28 случаев заражения, по 23 апреля, когда зафиксировали уже 62 773 подтвержденных случая. В число изученных вошли геномы (геном – минимальная единица наследственной информации организма, расшифровка которой помогает раскрыть свойства носителя генов. – Русфонд) пациентов из Петербурга, Москвы и еще 25 субъектов Федерации.

«Коронавирус довольно быстро изменяется: в его геноме случается примерно одна мутация за две недели. Большинство этих мутаций практически не изменяют свойства вируса. Зато их можно использовать, чтобы разобраться, кто, кого, когда и где заразил», – отмечает Базыкин.

Ученые утверждают, что коронавирус был завезен в Россию впервые в конце февраля – начале марта 2020 года, причем не из Китая, а из Европы. Следов пребывания SARS-CoV-2 до этого времени в РФ нет. По оценке исследователей, 211 вирусных геномов стали результатом 67 независимых завозов. По крайней мере девять завозов привели к собственным российским вариантам вируса, которые «циркулируют только здесь». «Во многих случаях мы можем сказать, откуда был привезен тот или иной вариант вируса, точно. Когда есть прямые данные о поездках, это подтверждается. Житель Чечни съездил на хадж в Мекку – и привезенный им вирус кластеризуется (близок к штаммам. – Русфонд) с вирусами из Саудовской Аравии. Топ-менеджеры Якутской топливно-энергетической компании слетали в Швейцарию – и привезенный ими в Якутск вирус кластеризуется со швейцарскими [вирусами]», – подчеркивает Базыкин.

Особое внимание ученых привлек петербургский НМИЦ имени Вредена, в котором было изолировано на 35 дней карантина 474 пациента и 270 медработников. Коронавирусом переболели свыше 400 человек. Карантин был введен в НМИЦ между 7 и 9 апреля, до его введения вирус быстро распространялся: коэффициент репродукции Rt был равен 3,7, то есть каждый заболевший заражал около трех человек. После того как отделения были изолированы друг от друга и переболела значительная доля медиков и пациентов, распространение замедлилось – Rt составил около 1,4. По результатам исследования стало ясно, что SARS-CoV-2 попадал в учреждение не один раз, как утверждали петербургские власти, а несколько и каждый раз в рамках большой общей вспышки заболевания возникала малая. Базыкин отмечает, что, несмотря на карантин, из НМИЦ имени Вредена вирус распространился по всему Санкт‑Петербургу, потому что «вреденскими» вариантами коронавируса болели петербуржцы, которые не имели к исследовательскому центру никакого отношения.

Первый полный геном коронавируса SARS-CoV-2 из материала от пациента из России был секвенирован специалистами НИИ гриппа имени Смородинцева.